Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pdcd5P56812 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pdcd5P56812 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms