Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtskP55097 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CtskP55097 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtskP55097 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtskP55097 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtskP55097 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtskP55097 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtskP55097 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtskP55097 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CtskP55097 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtskP55097 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtskP55097 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtskP55097 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtskP55097 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtskP55097 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtskP55097 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtskP55097 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CtskP55097 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtskP55097 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtskP55097 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CtskP55097 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtskP55097 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtskP55097 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtskP55097 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtskP55097 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtskP55097 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtskP55097 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtskP55097 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtskP55097 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CtskP55097 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtskP55097 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtskP55097 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtskP55097 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtskP55097 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CtskP55097 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtskP55097 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtskP55097 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtskP55097 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtskP55097 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CtskP55097 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CtskP55097 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtskP55097 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtskP55097 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtskP55097 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtskP55097 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtskP55097 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtskP55097 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtskP55097 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtskP55097 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtskP55097 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtskP55097 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CtskP55097 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtskP55097 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtskP55097 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtskP55097 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtskP55097 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtskP55097 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtskP55097 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtskP55097 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtskP55097 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtskP55097 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtskP55097 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CtskP55097 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtskP55097 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtskP55097 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CtskP55097 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtskP55097 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtskP55097 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtskP55097 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CtskP55097 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtskP55097 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtskP55097 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtskP55097 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtskP55097 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtskP55097 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtskP55097 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtskP55097 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtskP55097 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CtskP55097 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CtskP55097 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtskP55097 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtskP55097 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtskP55097 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtskP55097 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtskP55097 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtskP55097 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtskP55097 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtskP55097 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CtskP55097 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CtskP55097 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtskP55097 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtskP55097 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtskP55097 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtskP55097 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtskP55097 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtskP55097 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CtskP55097 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtskP55097 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtskP55097 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CtskP55097 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms