Protein–RNA interactions for Protein: P55096

Abcd3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd3P55096 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Abcd3P55096 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms