Protein–RNA interactions for Protein: P54987

Acod1, Cis-aconitate decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acod1P54987 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acod1P54987 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acod1P54987 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acod1P54987 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acod1P54987 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acod1P54987 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acod1P54987 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Acod1P54987 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Acod1P54987 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Acod1P54987 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms