Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ephb3P54754 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ephb3P54754 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ephb3P54754 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ephb3P54754 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ephb3P54754 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ephb3P54754 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ephb3P54754 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ephb3P54754 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ephb3P54754 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ephb3P54754 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ephb3P54754 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ephb3P54754 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ephb3P54754 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ephb3P54754 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ephb3P54754 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ephb3P54754 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ephb3P54754 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ephb3P54754 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ephb3P54754 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ephb3P54754 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ephb3P54754 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ephb3P54754 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ephb3P54754 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ephb3P54754 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ephb3P54754 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ephb3P54754 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ephb3P54754 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ephb3P54754 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ephb3P54754 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ephb3P54754 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ephb3P54754 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ephb3P54754 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ephb3P54754 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ephb3P54754 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ephb3P54754 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ephb3P54754 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ephb3P54754 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ephb3P54754 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ephb3P54754 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ephb3P54754 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ephb3P54754 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ephb3P54754 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ephb3P54754 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ephb3P54754 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ephb3P54754 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ephb3P54754 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ephb3P54754 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ephb3P54754 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ephb3P54754 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ephb3P54754 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ephb3P54754 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ephb3P54754 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ephb3P54754 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ephb3P54754 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ephb3P54754 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ephb3P54754 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ephb3P54754 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ephb3P54754 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ephb3P54754 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ephb3P54754 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ephb3P54754 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ephb3P54754 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ephb3P54754 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ephb3P54754 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ephb3P54754 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ephb3P54754 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ephb3P54754 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ephb3P54754 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ephb3P54754 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ephb3P54754 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms