Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fdft1P53798 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Fdft1P53798 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms