Protein–RNA interactions for Protein: P53776

Lhx4, LIM/homeobox protein Lhx4, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx4P53776 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lhx4P53776 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lhx4P53776 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms