Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Upp1P52624 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Upp1P52624 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Upp1P52624 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Upp1P52624 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Upp1P52624 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Upp1P52624 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Upp1P52624 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Upp1P52624 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Upp1P52624 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Upp1P52624 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Upp1P52624 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Upp1P52624 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms