Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ApodP51910 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ApodP51910 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ApodP51910 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ApodP51910 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ApodP51910 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ApodP51910 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ApodP51910 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ApodP51910 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ApodP51910 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ApodP51910 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ApodP51910 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ApodP51910 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ApodP51910 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ApodP51910 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ApodP51910 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ApodP51910 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ApodP51910 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ApodP51910 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ApodP51910 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ApodP51910 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ApodP51910 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ApodP51910 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ApodP51910 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ApodP51910 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ApodP51910 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ApodP51910 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ApodP51910 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ApodP51910 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ApodP51910 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ApodP51910 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ApodP51910 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ApodP51910 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ApodP51910 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ApodP51910 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ApodP51910 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ApodP51910 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ApodP51910 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ApodP51910 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ApodP51910 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ApodP51910 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ApodP51910 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ApodP51910 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ApodP51910 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ApodP51910 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ApodP51910 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ApodP51910 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ApodP51910 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ApodP51910 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ApodP51910 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ApodP51910 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ApodP51910 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ApodP51910 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ApodP51910 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ApodP51910 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ApodP51910 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ApodP51910 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ApodP51910 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ApodP51910 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ApodP51910 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ApodP51910 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ApodP51910 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ApodP51910 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ApodP51910 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ApodP51910 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ApodP51910 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ApodP51910 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ApodP51910 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ApodP51910 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ApodP51910 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ApodP51910 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ApodP51910 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ApodP51910 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ApodP51910 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ApodP51910 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ApodP51910 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ApodP51910 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ApodP51910 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ApodP51910 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ApodP51910 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ApodP51910 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ApodP51910 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ApodP51910 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ApodP51910 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ApodP51910 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ApodP51910 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ApodP51910 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ApodP51910 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ApodP51910 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ApodP51910 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ApodP51910 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ApodP51910 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ApodP51910 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ApodP51910 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ApodP51910 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ApodP51910 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ApodP51910 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ApodP51910 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ApodP51910 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ApodP51910 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms