Protein–RNA interactions for Protein: P51125

Cast, Calpastatin, mousemouse

Predictions only

Length 788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CastP51125 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CastP51125 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CastP51125 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CastP51125 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CastP51125 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CastP51125 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CastP51125 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CastP51125 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CastP51125 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CastP51125 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CastP51125 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CastP51125 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CastP51125 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CastP51125 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CastP51125 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CastP51125 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CastP51125 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CastP51125 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CastP51125 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CastP51125 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CastP51125 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CastP51125 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CastP51125 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CastP51125 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CastP51125 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CastP51125 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CastP51125 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CastP51125 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CastP51125 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CastP51125 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CastP51125 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CastP51125 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CastP51125 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CastP51125 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CastP51125 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CastP51125 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CastP51125 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CastP51125 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CastP51125 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CastP51125 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CastP51125 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CastP51125 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CastP51125 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CastP51125 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CastP51125 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CastP51125 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CastP51125 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CastP51125 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CastP51125 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CastP51125 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CastP51125 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CastP51125 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CastP51125 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CastP51125 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CastP51125 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CastP51125 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CastP51125 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CastP51125 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CastP51125 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CastP51125 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CastP51125 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CastP51125 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CastP51125 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CastP51125 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CastP51125 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CastP51125 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CastP51125 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CastP51125 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CastP51125 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CastP51125 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CastP51125 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CastP51125 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CastP51125 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CastP51125 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CastP51125 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CastP51125 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CastP51125 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CastP51125 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CastP51125 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CastP51125 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CastP51125 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CastP51125 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CastP51125 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CastP51125 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CastP51125 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CastP51125 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CastP51125 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CastP51125 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CastP51125 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CastP51125 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CastP51125 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CastP51125 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CastP51125 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CastP51125 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CastP51125 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CastP51125 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CastP51125 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CastP51125 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CastP51125 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CastP51125 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms