Protein–RNA interactions for Protein: P50752

Tnnt2, Troponin T, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt2P50752 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnnt2P50752 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnnt2P50752 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnnt2P50752 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tnnt2P50752 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Tnnt2P50752 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tnnt2P50752 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tnnt2P50752 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms