Protein–RNA interactions for Protein: P50716

Defa-rs12, Alpha-defensin-related sequence 12, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs12P50716 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa-rs12P50716 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defa-rs12P50716 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defa-rs12P50716 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Defa-rs12P50716 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defa-rs12P50716 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defa-rs12P50716 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defa-rs12P50716 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defa-rs12P50716 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defa-rs12P50716 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Defa-rs12P50716 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Defa-rs12P50716 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Defa-rs12P50716 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Defa-rs12P50716 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Defa-rs12P50716 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Defa-rs12P50716 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Defa-rs12P50716 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Defa-rs12P50716 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Defa-rs12P50716 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Defa-rs12P50716 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Defa-rs12P50716 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Defa-rs12P50716 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Defa-rs12P50716 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Defa-rs12P50716 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Defa-rs12P50716 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Defa-rs12P50716 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Defa-rs12P50716 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Defa-rs12P50716 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa-rs12P50716 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa-rs12P50716 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa-rs12P50716 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa-rs12P50716 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa-rs12P50716 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa-rs12P50716 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa-rs12P50716 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa-rs12P50716 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa-rs12P50716 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms