Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TspoP50637 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TspoP50637 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TspoP50637 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TspoP50637 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TspoP50637 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TspoP50637 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TspoP50637 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TspoP50637 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TspoP50637 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TspoP50637 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TspoP50637 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TspoP50637 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TspoP50637 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TspoP50637 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TspoP50637 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TspoP50637 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TspoP50637 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TspoP50637 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TspoP50637 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TspoP50637 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TspoP50637 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TspoP50637 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TspoP50637 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TspoP50637 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TspoP50637 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TspoP50637 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TspoP50637 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TspoP50637 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TspoP50637 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TspoP50637 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TspoP50637 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TspoP50637 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TspoP50637 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TspoP50637 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TspoP50637 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TspoP50637 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TspoP50637 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TspoP50637 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TspoP50637 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TspoP50637 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TspoP50637 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TspoP50637 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TspoP50637 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TspoP50637 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TspoP50637 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TspoP50637 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TspoP50637 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TspoP50637 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TspoP50637 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TspoP50637 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TspoP50637 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TspoP50637 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TspoP50637 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TspoP50637 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TspoP50637 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TspoP50637 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TspoP50637 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TspoP50637 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TspoP50637 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TspoP50637 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TspoP50637 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TspoP50637 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TspoP50637 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TspoP50637 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TspoP50637 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TspoP50637 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TspoP50637 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TspoP50637 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TspoP50637 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TspoP50637 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TspoP50637 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TspoP50637 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TspoP50637 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TspoP50637 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TspoP50637 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TspoP50637 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TspoP50637 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TspoP50637 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TspoP50637 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TspoP50637 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TspoP50637 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TspoP50637 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TspoP50637 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TspoP50637 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TspoP50637 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TspoP50637 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TspoP50637 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TspoP50637 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TspoP50637 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TspoP50637 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TspoP50637 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TspoP50637 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TspoP50637 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TspoP50637 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TspoP50637 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TspoP50637 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TspoP50637 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TspoP50637 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TspoP50637 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms