Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxc13P50207 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxc13P50207 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms