Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmod1P49813 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmod1P49813 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmod1P49813 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmod1P49813 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmod1P49813 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmod1P49813 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmod1P49813 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmod1P49813 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmod1P49813 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmod1P49813 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmod1P49813 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmod1P49813 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmod1P49813 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmod1P49813 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmod1P49813 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmod1P49813 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmod1P49813 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmod1P49813 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmod1P49813 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmod1P49813 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmod1P49813 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmod1P49813 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmod1P49813 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmod1P49813 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmod1P49813 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmod1P49813 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmod1P49813 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmod1P49813 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmod1P49813 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmod1P49813 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmod1P49813 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmod1P49813 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmod1P49813 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmod1P49813 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmod1P49813 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmod1P49813 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
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