Protein–RNA interactions for Protein: P48432

Sox2, Transcription factor SOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox2P48432 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox2P48432 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox2P48432 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox2P48432 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox2P48432 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox2P48432 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox2P48432 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sox2P48432 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox2P48432 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox2P48432 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox2P48432 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox2P48432 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox2P48432 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox2P48432 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox2P48432 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox2P48432 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox2P48432 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox2P48432 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox2P48432 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox2P48432 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox2P48432 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sox2P48432 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox2P48432 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox2P48432 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox2P48432 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox2P48432 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox2P48432 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox2P48432 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox2P48432 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox2P48432 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox2P48432 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox2P48432 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox2P48432 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox2P48432 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox2P48432 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox2P48432 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox2P48432 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox2P48432 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox2P48432 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sox2P48432 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms