Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Abcd1P48410 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Abcd1P48410 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms