Protein–RNA interactions for Protein: P48298

Ccl11, Eotaxin, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl11P48298 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl11P48298 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms