Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
VdrP48281 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
VdrP48281 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
VdrP48281 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VdrP48281 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VdrP48281 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VdrP48281 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VdrP48281 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VdrP48281 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VdrP48281 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VdrP48281 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VdrP48281 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VdrP48281 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VdrP48281 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VdrP48281 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VdrP48281 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VdrP48281 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
VdrP48281 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VdrP48281 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
VdrP48281 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VdrP48281 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
VdrP48281 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VdrP48281 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VdrP48281 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VdrP48281 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VdrP48281 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VdrP48281 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
VdrP48281 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VdrP48281 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VdrP48281 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VdrP48281 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VdrP48281 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
VdrP48281 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VdrP48281 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VdrP48281 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VdrP48281 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VdrP48281 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VdrP48281 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VdrP48281 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VdrP48281 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
VdrP48281 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
VdrP48281 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VdrP48281 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VdrP48281 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VdrP48281 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VdrP48281 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VdrP48281 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VdrP48281 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VdrP48281 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VdrP48281 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VdrP48281 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VdrP48281 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VdrP48281 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VdrP48281 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VdrP48281 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VdrP48281 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
VdrP48281 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VdrP48281 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VdrP48281 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VdrP48281 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VdrP48281 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VdrP48281 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VdrP48281 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VdrP48281 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VdrP48281 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VdrP48281 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VdrP48281 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VdrP48281 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VdrP48281 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VdrP48281 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VdrP48281 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
VdrP48281 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VdrP48281 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VdrP48281 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VdrP48281 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VdrP48281 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VdrP48281 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VdrP48281 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VdrP48281 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VdrP48281 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VdrP48281 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VdrP48281 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VdrP48281 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VdrP48281 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VdrP48281 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VdrP48281 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VdrP48281 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VdrP48281 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VdrP48281 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VdrP48281 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VdrP48281 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VdrP48281 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VdrP48281 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VdrP48281 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VdrP48281 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VdrP48281 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VdrP48281 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VdrP48281 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VdrP48281 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VdrP48281 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms