Protein–RNA interactions for Protein: P47934

Crat, Carnitine O-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CratP47934 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CratP47934 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CratP47934 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CratP47934 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CratP47934 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CratP47934 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CratP47934 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CratP47934 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CratP47934 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CratP47934 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CratP47934 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CratP47934 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CratP47934 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CratP47934 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CratP47934 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CratP47934 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CratP47934 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CratP47934 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CratP47934 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CratP47934 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CratP47934 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CratP47934 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CratP47934 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CratP47934 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CratP47934 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CratP47934 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CratP47934 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CratP47934 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CratP47934 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CratP47934 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CratP47934 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CratP47934 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CratP47934 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CratP47934 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CratP47934 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CratP47934 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CratP47934 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CratP47934 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CratP47934 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CratP47934 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CratP47934 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CratP47934 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CratP47934 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CratP47934 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CratP47934 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CratP47934 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CratP47934 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CratP47934 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CratP47934 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CratP47934 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CratP47934 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CratP47934 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CratP47934 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CratP47934 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CratP47934 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CratP47934 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CratP47934 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CratP47934 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CratP47934 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CratP47934 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CratP47934 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CratP47934 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CratP47934 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CratP47934 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CratP47934 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CratP47934 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CratP47934 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CratP47934 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CratP47934 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CratP47934 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CratP47934 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CratP47934 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CratP47934 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CratP47934 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CratP47934 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CratP47934 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CratP47934 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CratP47934 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CratP47934 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CratP47934 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CratP47934 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CratP47934 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CratP47934 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CratP47934 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CratP47934 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CratP47934 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CratP47934 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CratP47934 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CratP47934 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CratP47934 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CratP47934 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CratP47934 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CratP47934 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CratP47934 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CratP47934 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CratP47934 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CratP47934 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CratP47934 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CratP47934 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CratP47934 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms