Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pax7P47239 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pax7P47239 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pax7P47239 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pax7P47239 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pax7P47239 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pax7P47239 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pax7P47239 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pax7P47239 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pax7P47239 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pax7P47239 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms