Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nedd4P46935 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nedd4P46935 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nedd4P46935 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nedd4P46935 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nedd4P46935 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nedd4P46935 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nedd4P46935 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nedd4P46935 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nedd4P46935 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nedd4P46935 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nedd4P46935 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nedd4P46935 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Nedd4P46935 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Nedd4P46935 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Nedd4P46935 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nedd4P46935 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nedd4P46935 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nedd4P46935 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nedd4P46935 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nedd4P46935 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nedd4P46935 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nedd4P46935 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nedd4P46935 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nedd4P46935 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nedd4P46935 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nedd4P46935 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nedd4P46935 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nedd4P46935 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nedd4P46935 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms