Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab11bP46638 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab11bP46638 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab11bP46638 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab11bP46638 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab11bP46638 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab11bP46638 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab11bP46638 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab11bP46638 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab11bP46638 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab11bP46638 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab11bP46638 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab11bP46638 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab11bP46638 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab11bP46638 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab11bP46638 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab11bP46638 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab11bP46638 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab11bP46638 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab11bP46638 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab11bP46638 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab11bP46638 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab11bP46638 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab11bP46638 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab11bP46638 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab11bP46638 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab11bP46638 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab11bP46638 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab11bP46638 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab11bP46638 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab11bP46638 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab11bP46638 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab11bP46638 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab11bP46638 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab11bP46638 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab11bP46638 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab11bP46638 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab11bP46638 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab11bP46638 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab11bP46638 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab11bP46638 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab11bP46638 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab11bP46638 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab11bP46638 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab11bP46638 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab11bP46638 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab11bP46638 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab11bP46638 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab11bP46638 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab11bP46638 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab11bP46638 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab11bP46638 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab11bP46638 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab11bP46638 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab11bP46638 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab11bP46638 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab11bP46638 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab11bP46638 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab11bP46638 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab11bP46638 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab11bP46638 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab11bP46638 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab11bP46638 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab11bP46638 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab11bP46638 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab11bP46638 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab11bP46638 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab11bP46638 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab11bP46638 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms