Protein–RNA interactions for Protein: P42581

Hmx3, Homeobox protein HMX3, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx3P42581 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmx3P42581 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmx3P42581 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmx3P42581 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmx3P42581 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmx3P42581 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmx3P42581 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmx3P42581 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmx3P42581 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmx3P42581 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmx3P42581 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmx3P42581 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmx3P42581 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmx3P42581 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmx3P42581 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmx3P42581 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmx3P42581 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmx3P42581 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmx3P42581 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmx3P42581 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmx3P42581 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmx3P42581 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmx3P42581 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmx3P42581 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmx3P42581 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmx3P42581 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmx3P42581 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmx3P42581 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmx3P42581 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmx3P42581 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmx3P42581 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmx3P42581 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmx3P42581 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmx3P42581 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmx3P42581 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmx3P42581 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmx3P42581 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmx3P42581 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmx3P42581 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmx3P42581 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmx3P42581 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmx3P42581 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmx3P42581 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmx3P42581 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmx3P42581 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmx3P42581 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmx3P42581 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmx3P42581 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmx3P42581 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmx3P42581 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmx3P42581 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmx3P42581 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmx3P42581 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmx3P42581 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmx3P42581 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmx3P42581 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hmx3P42581 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hmx3P42581 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hmx3P42581 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmx3P42581 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmx3P42581 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmx3P42581 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmx3P42581 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmx3P42581 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmx3P42581 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmx3P42581 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmx3P42581 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmx3P42581 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmx3P42581 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmx3P42581 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmx3P42581 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmx3P42581 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmx3P42581 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmx3P42581 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmx3P42581 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmx3P42581 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmx3P42581 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmx3P42581 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hmx3P42581 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmx3P42581 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmx3P42581 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmx3P42581 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmx3P42581 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmx3P42581 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmx3P42581 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmx3P42581 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmx3P42581 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmx3P42581 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmx3P42581 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmx3P42581 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmx3P42581 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmx3P42581 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmx3P42581 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmx3P42581 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmx3P42581 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmx3P42581 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hmx3P42581 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmx3P42581 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmx3P42581 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hmx3P42581 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms