Protein–RNA interactions for Protein: P40646

Sox7, Transcription factor SOX-7, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox7P40646 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox7P40646 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox7P40646 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox7P40646 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox7P40646 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox7P40646 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox7P40646 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox7P40646 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sox7P40646 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox7P40646 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox7P40646 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sox7P40646 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox7P40646 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox7P40646 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox7P40646 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox7P40646 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox7P40646 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sox7P40646 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox7P40646 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox7P40646 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox7P40646 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox7P40646 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms