Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VhlP40338 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VhlP40338 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VhlP40338 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VhlP40338 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VhlP40338 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VhlP40338 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VhlP40338 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VhlP40338 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VhlP40338 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VhlP40338 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VhlP40338 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VhlP40338 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VhlP40338 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
VhlP40338 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VhlP40338 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VhlP40338 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VhlP40338 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VhlP40338 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VhlP40338 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VhlP40338 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VhlP40338 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VhlP40338 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VhlP40338 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VhlP40338 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VhlP40338 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VhlP40338 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VhlP40338 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VhlP40338 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VhlP40338 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VhlP40338 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VhlP40338 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VhlP40338 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VhlP40338 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VhlP40338 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VhlP40338 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VhlP40338 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VhlP40338 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VhlP40338 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VhlP40338 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VhlP40338 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VhlP40338 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VhlP40338 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VhlP40338 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VhlP40338 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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VhlP40338 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VhlP40338 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VhlP40338 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VhlP40338 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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VhlP40338 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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VhlP40338 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VhlP40338 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VhlP40338 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VhlP40338 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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VhlP40338 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VhlP40338 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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VhlP40338 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VhlP40338 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VhlP40338 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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VhlP40338 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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VhlP40338 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VhlP40338 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VhlP40338 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VhlP40338 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VhlP40338 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VhlP40338 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VhlP40338 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VhlP40338 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VhlP40338 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VhlP40338 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VhlP40338 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VhlP40338 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VhlP40338 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VhlP40338 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
VhlP40338 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VhlP40338 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
VhlP40338 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
VhlP40338 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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