Protein–RNA interactions for Protein: P40223

Csf3r, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3rP40223 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Csf3rP40223 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms