Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grik2P39087 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grik2P39087 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grik2P39087 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grik2P39087 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grik2P39087 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grik2P39087 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grik2P39087 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grik2P39087 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Grik2P39087 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grik2P39087 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grik2P39087 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grik2P39087 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grik2P39087 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grik2P39087 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grik2P39087 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grik2P39087 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grik2P39087 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grik2P39087 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grik2P39087 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grik2P39087 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grik2P39087 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grik2P39087 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grik2P39087 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Grik2P39087 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grik2P39087 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grik2P39087 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grik2P39087 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grik2P39087 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grik2P39087 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grik2P39087 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grik2P39087 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grik2P39087 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Grik2P39087 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grik2P39087 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grik2P39087 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grik2P39087 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grik2P39087 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grik2P39087 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grik2P39087 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grik2P39087 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grik2P39087 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grik2P39087 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grik2P39087 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grik2P39087 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grik2P39087 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grik2P39087 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grik2P39087 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grik2P39087 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grik2P39087 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grik2P39087 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grik2P39087 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grik2P39087 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grik2P39087 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik2P39087 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik2P39087 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms