Protein–RNA interactions for Protein: P36536

Sar1a, GTP-binding protein SAR1a, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1aP36536 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sar1aP36536 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sar1aP36536 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms