Protein–RNA interactions for Protein: P36368

Egfbp2, Epidermal growth factor-binding protein type B, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egfbp2P36368 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Egfbp2P36368 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Egfbp2P36368 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Egfbp2P36368 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Egfbp2P36368 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Egfbp2P36368 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Egfbp2P36368 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Egfbp2P36368 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Egfbp2P36368 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Egfbp2P36368 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Egfbp2P36368 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Egfbp2P36368 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Egfbp2P36368 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Egfbp2P36368 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Egfbp2P36368 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Egfbp2P36368 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Egfbp2P36368 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Egfbp2P36368 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Egfbp2P36368 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Egfbp2P36368 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Egfbp2P36368 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Egfbp2P36368 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Egfbp2P36368 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Egfbp2P36368 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Egfbp2P36368 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Egfbp2P36368 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Egfbp2P36368 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Egfbp2P36368 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Egfbp2P36368 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Egfbp2P36368 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Egfbp2P36368 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Egfbp2P36368 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Egfbp2P36368 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Egfbp2P36368 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Egfbp2P36368 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Egfbp2P36368 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Egfbp2P36368 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Egfbp2P36368 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Egfbp2P36368 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Egfbp2P36368 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Egfbp2P36368 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Egfbp2P36368 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Egfbp2P36368 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Egfbp2P36368 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Egfbp2P36368 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Egfbp2P36368 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Egfbp2P36368 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Egfbp2P36368 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Egfbp2P36368 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Egfbp2P36368 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Egfbp2P36368 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Egfbp2P36368 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Egfbp2P36368 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Egfbp2P36368 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Egfbp2P36368 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Egfbp2P36368 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Egfbp2P36368 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Egfbp2P36368 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Egfbp2P36368 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Egfbp2P36368 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Egfbp2P36368 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Egfbp2P36368 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Egfbp2P36368 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Egfbp2P36368 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Egfbp2P36368 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Egfbp2P36368 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Egfbp2P36368 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Egfbp2P36368 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Egfbp2P36368 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Egfbp2P36368 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Egfbp2P36368 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Egfbp2P36368 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Egfbp2P36368 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Egfbp2P36368 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Egfbp2P36368 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Egfbp2P36368 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Egfbp2P36368 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Egfbp2P36368 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Egfbp2P36368 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Egfbp2P36368 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Egfbp2P36368 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Egfbp2P36368 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Egfbp2P36368 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Egfbp2P36368 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Egfbp2P36368 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Egfbp2P36368 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Egfbp2P36368 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Egfbp2P36368 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Egfbp2P36368 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Egfbp2P36368 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Egfbp2P36368 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Egfbp2P36368 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Egfbp2P36368 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Egfbp2P36368 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Egfbp2P36368 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Egfbp2P36368 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Egfbp2P36368 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Egfbp2P36368 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Egfbp2P36368 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Egfbp2P36368 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms