Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ddit3P35639 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ddit3P35639 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ddit3P35639 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ddit3P35639 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ddit3P35639 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ddit3P35639 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ddit3P35639 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ddit3P35639 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ddit3P35639 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ddit3P35639 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ddit3P35639 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ddit3P35639 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ddit3P35639 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ddit3P35639 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ddit3P35639 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ddit3P35639 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ddit3P35639 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ddit3P35639 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ddit3P35639 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ddit3P35639 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ddit3P35639 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ddit3P35639 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ddit3P35639 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ddit3P35639 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ddit3P35639 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ddit3P35639 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ddit3P35639 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ddit3P35639 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ddit3P35639 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ddit3P35639 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ddit3P35639 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ddit3P35639 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ddit3P35639 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ddit3P35639 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ddit3P35639 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms