Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TpoP35419 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TpoP35419 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TpoP35419 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TpoP35419 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TpoP35419 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TpoP35419 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TpoP35419 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TpoP35419 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TpoP35419 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TpoP35419 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TpoP35419 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TpoP35419 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TpoP35419 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TpoP35419 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TpoP35419 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TpoP35419 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TpoP35419 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TpoP35419 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TpoP35419 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TpoP35419 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TpoP35419 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TpoP35419 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TpoP35419 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TpoP35419 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TpoP35419 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TpoP35419 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TpoP35419 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TpoP35419 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TpoP35419 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TpoP35419 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TpoP35419 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TpoP35419 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TpoP35419 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TpoP35419 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TpoP35419 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TpoP35419 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TpoP35419 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TpoP35419 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TpoP35419 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TpoP35419 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TpoP35419 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TpoP35419 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TpoP35419 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TpoP35419 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TpoP35419 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TpoP35419 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TpoP35419 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TpoP35419 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TpoP35419 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TpoP35419 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TpoP35419 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TpoP35419 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TpoP35419 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TpoP35419 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TpoP35419 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TpoP35419 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TpoP35419 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TpoP35419 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TpoP35419 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TpoP35419 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TpoP35419 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TpoP35419 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TpoP35419 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TpoP35419 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TpoP35419 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TpoP35419 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TpoP35419 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TpoP35419 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TpoP35419 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TpoP35419 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TpoP35419 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TpoP35419 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TpoP35419 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TpoP35419 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TpoP35419 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TpoP35419 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TpoP35419 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TpoP35419 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TpoP35419 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TpoP35419 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TpoP35419 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TpoP35419 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TpoP35419 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TpoP35419 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TpoP35419 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TpoP35419 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TpoP35419 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TpoP35419 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TpoP35419 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TpoP35419 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TpoP35419 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TpoP35419 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TpoP35419 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TpoP35419 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TpoP35419 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TpoP35419 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TpoP35419 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TpoP35419 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TpoP35419 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms