Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab5cP35278 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab5cP35278 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab5cP35278 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab5cP35278 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab5cP35278 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab5cP35278 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab5cP35278 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab5cP35278 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab5cP35278 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab5cP35278 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab5cP35278 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab5cP35278 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab5cP35278 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rab5cP35278 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab5cP35278 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab5cP35278 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab5cP35278 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab5cP35278 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab5cP35278 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab5cP35278 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab5cP35278 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab5cP35278 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab5cP35278 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab5cP35278 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab5cP35278 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab5cP35278 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab5cP35278 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab5cP35278 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab5cP35278 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab5cP35278 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab5cP35278 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab5cP35278 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab5cP35278 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab5cP35278 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab5cP35278 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab5cP35278 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab5cP35278 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Rab5cP35278 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab5cP35278 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab5cP35278 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab5cP35278 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab5cP35278 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab5cP35278 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab5cP35278 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab5cP35278 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab5cP35278 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab5cP35278 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab5cP35278 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab5cP35278 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab5cP35278 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab5cP35278 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab5cP35278 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab5cP35278 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rab5cP35278 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab5cP35278 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab5cP35278 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab5cP35278 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab5cP35278 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab5cP35278 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab5cP35278 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rab5cP35278 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rab5cP35278 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rab5cP35278 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab5cP35278 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab5cP35278 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab5cP35278 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab5cP35278 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab5cP35278 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab5cP35278 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab5cP35278 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab5cP35278 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab5cP35278 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab5cP35278 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab5cP35278 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab5cP35278 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab5cP35278 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab5cP35278 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab5cP35278 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab5cP35278 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab5cP35278 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab5cP35278 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab5cP35278 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab5cP35278 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab5cP35278 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab5cP35278 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab5cP35278 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab5cP35278 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab5cP35278 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab5cP35278 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab5cP35278 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab5cP35278 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab5cP35278 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab5cP35278 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab5cP35278 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab5cP35278 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab5cP35278 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab5cP35278 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab5cP35278 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab5cP35278 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms