Protein–RNA interactions for Protein: P35276

Rab3d, Ras-related protein Rab-3D, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3dP35276 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms