Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sftpa1P35242 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms