Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxc5P32043 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxc5P32043 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms