Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxc11P31313 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxc11P31313 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms