Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msr1P30204 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Msr1P30204 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Msr1P30204 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Msr1P30204 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Msr1P30204 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Msr1P30204 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Msr1P30204 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Msr1P30204 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Msr1P30204 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Msr1P30204 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Msr1P30204 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Msr1P30204 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Msr1P30204 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Msr1P30204 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Msr1P30204 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Msr1P30204 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Msr1P30204 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Msr1P30204 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Msr1P30204 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Msr1P30204 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Msr1P30204 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Msr1P30204 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms