Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VtnP29788 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VtnP29788 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VtnP29788 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VtnP29788 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
VtnP29788 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VtnP29788 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VtnP29788 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VtnP29788 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VtnP29788 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VtnP29788 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VtnP29788 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VtnP29788 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VtnP29788 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VtnP29788 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VtnP29788 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VtnP29788 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VtnP29788 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VtnP29788 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VtnP29788 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VtnP29788 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VtnP29788 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VtnP29788 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VtnP29788 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
VtnP29788 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
VtnP29788 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VtnP29788 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VtnP29788 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VtnP29788 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VtnP29788 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
VtnP29788 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VtnP29788 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VtnP29788 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VtnP29788 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VtnP29788 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VtnP29788 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VtnP29788 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VtnP29788 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VtnP29788 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VtnP29788 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
VtnP29788 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VtnP29788 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VtnP29788 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VtnP29788 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VtnP29788 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VtnP29788 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VtnP29788 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VtnP29788 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VtnP29788 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VtnP29788 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VtnP29788 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VtnP29788 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VtnP29788 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VtnP29788 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VtnP29788 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VtnP29788 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VtnP29788 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VtnP29788 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VtnP29788 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VtnP29788 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VtnP29788 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VtnP29788 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VtnP29788 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VtnP29788 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VtnP29788 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VtnP29788 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VtnP29788 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VtnP29788 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VtnP29788 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VtnP29788 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VtnP29788 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VtnP29788 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VtnP29788 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VtnP29788 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VtnP29788 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VtnP29788 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VtnP29788 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VtnP29788 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VtnP29788 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VtnP29788 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VtnP29788 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
VtnP29788 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
VtnP29788 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VtnP29788 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VtnP29788 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VtnP29788 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
VtnP29788 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VtnP29788 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VtnP29788 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VtnP29788 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VtnP29788 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VtnP29788 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VtnP29788 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VtnP29788 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VtnP29788 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VtnP29788 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VtnP29788 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VtnP29788 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VtnP29788 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VtnP29788 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms