Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casp1P29452 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casp1P29452 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casp1P29452 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casp1P29452 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casp1P29452 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casp1P29452 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casp1P29452 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casp1P29452 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casp1P29452 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casp1P29452 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casp1P29452 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casp1P29452 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casp1P29452 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casp1P29452 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casp1P29452 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casp1P29452 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casp1P29452 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casp1P29452 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casp1P29452 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casp1P29452 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casp1P29452 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casp1P29452 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Casp1P29452 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Casp1P29452 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Casp1P29452 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Casp1P29452 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Casp1P29452 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Casp1P29452 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Casp1P29452 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Casp1P29452 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Casp1P29452 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casp1P29452 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casp1P29452 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casp1P29452 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casp1P29452 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casp1P29452 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casp1P29452 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Casp1P29452 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casp1P29452 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casp1P29452 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casp1P29452 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casp1P29452 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casp1P29452 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casp1P29452 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casp1P29452 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Casp1P29452 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Casp1P29452 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Casp1P29452 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Casp1P29452 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Casp1P29452 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Casp1P29452 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Casp1P29452 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Casp1P29452 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Casp1P29452 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Casp1P29452 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Casp1P29452 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Casp1P29452 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Casp1P29452 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Casp1P29452 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Casp1P29452 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Casp1P29452 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casp1P29452 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casp1P29452 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Casp1P29452 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casp1P29452 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casp1P29452 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Casp1P29452 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Casp1P29452 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Casp1P29452 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Casp1P29452 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Casp1P29452 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Casp1P29452 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Casp1P29452 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Casp1P29452 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Casp1P29452 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Casp1P29452 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Casp1P29452 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Casp1P29452 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Casp1P29452 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Casp1P29452 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Casp1P29452 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Casp1P29452 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Casp1P29452 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Casp1P29452 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Casp1P29452 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Casp1P29452 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Casp1P29452 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Casp1P29452 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Casp1P29452 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Casp1P29452 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Casp1P29452 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Casp1P29452 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Casp1P29452 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Casp1P29452 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Casp1P29452 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Casp1P29452 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Casp1P29452 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Casp1P29452 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Casp1P29452 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms