Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pabpc1P29341 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms