Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hoxd10P28359 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hoxd10P28359 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hoxd10P28359 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hoxd10P28359 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hoxd10P28359 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd10P28359 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd10P28359 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd10P28359 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd10P28359 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd10P28359 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd10P28359 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd10P28359 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd10P28359 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd10P28359 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd10P28359 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd10P28359 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd10P28359 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxd10P28359 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxd10P28359 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxd10P28359 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxd10P28359 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxd10P28359 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxd10P28359 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxd10P28359 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxd10P28359 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxd10P28359 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxd10P28359 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxd10P28359 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxd10P28359 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxd10P28359 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxd10P28359 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxd10P28359 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxd10P28359 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxd10P28359 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxd10P28359 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd10P28359 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd10P28359 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd10P28359 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd10P28359 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd10P28359 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd10P28359 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd10P28359 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd10P28359 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd10P28359 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd10P28359 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd10P28359 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd10P28359 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd10P28359 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxd10P28359 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxd10P28359 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxd10P28359 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxd10P28359 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxd10P28359 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxd10P28359 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxd10P28359 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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Hoxd10P28359 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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Hoxd10P28359 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxd10P28359 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxd10P28359 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxd10P28359 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxd10P28359 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxd10P28359 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxd10P28359 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxd10P28359 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxd10P28359 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxd10P28359 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxd10P28359 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxd10P28359 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxd10P28359 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxd10P28359 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxd10P28359 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Hoxd10P28359 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Hoxd10P28359 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxd10P28359 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxd10P28359 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxd10P28359 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxd10P28359 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxd10P28359 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxd10P28359 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxd10P28359 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxd10P28359 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxd10P28359 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxd10P28359 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxd10P28359 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxd10P28359 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxd10P28359 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxd10P28359 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxd10P28359 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxd10P28359 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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