Protein–RNA interactions for Protein: P28322

Etv4, ETS translocation variant 4, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv4P28322 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Etv4P28322 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Etv4P28322 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Etv4P28322 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Etv4P28322 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Etv4P28322 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Etv4P28322 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Etv4P28322 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Etv4P28322 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Etv4P28322 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Etv4P28322 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Etv4P28322 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Etv4P28322 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Etv4P28322 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms