Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Defa2P28309 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Defa2P28309 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Defa2P28309 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Defa2P28309 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Defa2P28309 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Defa2P28309 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Defa2P28309 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Defa2P28309 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Defa2P28309 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Defa2P28309 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Defa2P28309 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Defa2P28309 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Defa2P28309 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Defa2P28309 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Defa2P28309 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Defa2P28309 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Defa2P28309 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Defa2P28309 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Defa2P28309 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Defa2P28309 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Defa2P28309 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Defa2P28309 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Defa2P28309 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Defa2P28309 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Defa2P28309 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Defa2P28309 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Defa2P28309 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Defa2P28309 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Defa2P28309 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Defa2P28309 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Defa2P28309 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Defa2P28309 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Defa2P28309 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Defa2P28309 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Defa2P28309 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Defa2P28309 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa2P28309 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa2P28309 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa2P28309 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa2P28309 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa2P28309 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa2P28309 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa2P28309 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa2P28309 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa2P28309 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa2P28309 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa2P28309 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa2P28309 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa2P28309 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa2P28309 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa2P28309 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa2P28309 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa2P28309 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa2P28309 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa2P28309 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa2P28309 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa2P28309 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa2P28309 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa2P28309 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Defa2P28309 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa2P28309 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa2P28309 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Defa2P28309 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms