Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb3P28231 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms