Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2-DMaP28078 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms