Protein–RNA interactions for Protein: P25911

Lyn, Tyrosine-protein kinase Lyn, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LynP25911 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LynP25911 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LynP25911 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LynP25911 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LynP25911 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LynP25911 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LynP25911 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LynP25911 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LynP25911 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LynP25911 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LynP25911 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LynP25911 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LynP25911 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LynP25911 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LynP25911 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LynP25911 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LynP25911 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LynP25911 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LynP25911 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LynP25911 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LynP25911 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LynP25911 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LynP25911 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LynP25911 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LynP25911 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LynP25911 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LynP25911 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LynP25911 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LynP25911 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LynP25911 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LynP25911 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LynP25911 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LynP25911 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LynP25911 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LynP25911 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LynP25911 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LynP25911 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LynP25911 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LynP25911 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LynP25911 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LynP25911 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
LynP25911 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LynP25911 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LynP25911 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LynP25911 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LynP25911 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LynP25911 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LynP25911 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
LynP25911 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LynP25911 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LynP25911 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LynP25911 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LynP25911 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LynP25911 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LynP25911 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LynP25911 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LynP25911 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LynP25911 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LynP25911 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LynP25911 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LynP25911 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LynP25911 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LynP25911 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LynP25911 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LynP25911 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LynP25911 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LynP25911 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LynP25911 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LynP25911 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LynP25911 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LynP25911 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LynP25911 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LynP25911 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LynP25911 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LynP25911 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LynP25911 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LynP25911 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LynP25911 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LynP25911 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LynP25911 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LynP25911 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LynP25911 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LynP25911 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LynP25911 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LynP25911 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LynP25911 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LynP25911 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LynP25911 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LynP25911 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LynP25911 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LynP25911 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LynP25911 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LynP25911 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LynP25911 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LynP25911 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LynP25911 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LynP25911 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LynP25911 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LynP25911 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LynP25911 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms