Protein–RNA interactions for Protein: P21271

Myo5b, Unconventional myosin-Vb, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5bP21271 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Myo5bP21271 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Myo5bP21271 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Myo5bP21271 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Myo5bP21271 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Myo5bP21271 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Myo5bP21271 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Myo5bP21271 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Myo5bP21271 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Myo5bP21271 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Myo5bP21271 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Myo5bP21271 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Myo5bP21271 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Myo5bP21271 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Myo5bP21271 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Myo5bP21271 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Myo5bP21271 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Myo5bP21271 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Myo5bP21271 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Myo5bP21271 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Myo5bP21271 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Myo5bP21271 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Myo5bP21271 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Myo5bP21271 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Myo5bP21271 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Myo5bP21271 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Myo5bP21271 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Myo5bP21271 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Myo5bP21271 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Myo5bP21271 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms