Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ms4a2P20490 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ms4a2P20490 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ms4a2P20490 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ms4a2P20490 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ms4a2P20490 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ms4a2P20490 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms