Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fcer1aP20489 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms